CRISPR: 한 줄을 겨냥해 다시 쓰다
Cas9가 DNA 이중나선을 따라 스캔하는 과정을 지켜보고, 가이드 RNA가 염기 상보성으로 표적에 결합하는 모습을 확인하고, PAM을 점검한 뒤 이중 가닥을 절단하고, 불일치가 특이성을 꺼버리는 과정을 확인해요.
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다시 쓸 단 한 문장
꼬여 있는 두 가닥의 리본이 DNA이고, 그 사이를 잇는 계단 하나하나가 염기쌍(A-T, G-C)이에요. 이 긴 글자열 어딘가에 다시 써야 할 단 한 곳, 바로 표적이 있어요. 초록빛으로 빛나는 12개의 염기가 그 표적(프로토스페이서)이고, 바로 옆의 주황빛 염기 3개는 PAM이라는 표지예요. 게놈은 30억 개의 글자로 이루어져 있어요. 그 안에서 단 한 문장을 어떻게 겨냥할 수 있을까요?
이중나선에서 초록빛 표적과 주황빛 PAM의 위치를 확인해보세요.
gRNA·5′-AUGCAGUCAUGC-3′→절단 없음
Targeting
가이드 일치율17%
절단 임계값80%
PAM (NGG)없음