Fai scorrere una catena di perline idrofobiche e polari da distesa a ripiegata, osserva il nucleo idrofobico seppellirsi nella conformazione nativa a bassa energia, e confrontala con un ripiegamento errato esposto.
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Una proteina è una catena di perle di amminoacidi infilate in un’unica linea. In questa esperienza riduciamo la loro natura a due tipi — idrofobico (H, colori caldi), a cui non piace l’acqua, e idrofilico (P, colori freddi), che va d’accordo con essa. Una catena appena formata è distesa così, con le perle idrofobiche esposte all’acqua — uno stato scomodo. Per prima cosa, osserva l’ordine della sequenza.
Traccia, lungo la catena distesa, in che ordine sono disposte le perle calde (H) e fredde (P).