Faites glisser une chaîne de billes hydrophobes et polaires de l'état étiré à l'état replié, observez le cœur hydrophobe s'enfouir dans le repliement natif de basse énergie, et comparez-le à un mauvais repliement exposé.
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Une protéine est une chaîne de perles d’acides aminés enfilées sur une seule ligne. Dans cette expérience, nous réduisons leur nature à deux types — hydrophobe (H, couleurs chaudes), qui n’aime pas l’eau, et hydrophile (P, couleurs froides), qui s’entend bien avec elle. Une chaîne fraîchement formée est étirée ainsi, avec les perles hydrophobes exposées à l’eau — un état inconfortable. Commencez par observer l’ordre de la séquence.
Suivez, le long de la chaîne étirée, l’ordre dans lequel les perles chaudes (H) et froides (P) sont disposées.